1) Atatürk ve Din, Süleyman Demirel Üniversitesi Rektörlüğü Yayınları No: 5 (S.D.Ü. İlahiyat Fakültesi Yayınları No: 5; Bilimsel Araştırmalar Yayın No: 1) Isparta, 1999, 78 s. , II. Baskı, Isparta, 2000., III. Baskı, Isparta 2001, IV. Baskı, Isparta, 2002, V. Baskı, Isparta, 2002
2) Kur’an’ı Anlamak, Ötüken Neşriyat, İstanbul, 2003
3) Türk-İslâm Kültüründe Ebced Hesabı ve Tarih Düşürme, Ötüken Yayınevi, İstanbul, 1992, 452 s. 2. Baskı, İstanbul, 2003
4) Hz. Peygamber’i Anlamak, Ötüken Neşriyat, İstanbul, 2003
5) l'Attitude du Christianisme et de l'Islam en Face du Darwinisme (Positions Exégétiques)-Etudes Comparées-Paris-IV, Sorbonne Üniversitesi'nde hazırlanmış ve savunulmuş Doktora Tezi, Paris, 1979. Gerekli ilave ve düzeltmelerden sonra l'Origine et l'Evolution de l'Homme Selon le Darwinisme, la Bible et le Coran adıyla yayındadır.
6) Ihvân-ı Safâ Felsefesinde Bilgi Problemi, I. Basım: Üçdal Neşr. İstanbul, 1985; II. Baskı: İ.Ü. Edebiyat Fakültesi Yayınları, No: 2699, Edebiyat Fakültesi Basımevi, İstanbul, 1992, 64 s.
7) Batı Düşüncesi ve Mevlâna, Ötüken Yayınevi, İstanbul, 1993, 196 s.; II. Baskı: Ötüken Yayınevi, İstanbul, 2000.
8) İslam’da Bilim Tarihi, 310 s., Tuğra Matb.,Isparta, 2002.
9) Arşiv Belgeleri Işığında Kızılcabölük, 220 s., Tuğra Matbaası,Isparta , 2002
10) Yunus Emre’de Sembolizm : Çıktım Erik Dalına, 98 s. T.C. Kültür Bakanlığı Yayınları/2819 (Sanat-Edebiyat Eserleri Dizisi/383-129, Uyum Ajans, Ankara, 2002
11) Türk-İslam Düşüncesi Üzerine Araştırmalar, Ötüken Neşriyat, İstanbul, 2002
12) Osmanlı Araştırmaları, 27 s., Fakülte Kitapevi, Isparta, 2002
13) İslamı Anlamak, Ötüken Neşriyat. İstanbul, 2005
14) Atatürk ve Milli Haysiyet (Baskıya hazırdır)
15)Evrim ve İslam (Baskıya hazırlanıyor)